Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCE3

PGM2L1, Glucose 1,6-bisphosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM2L1Q6PCE3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms