Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAVIN1Q6NZI2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAVIN1Q6NZI2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAVIN1Q6NZI2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.7 ms