Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUM9

RETSAT, All-trans-retinol 13,14-reductase, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETSATQ6NUM9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RETSATQ6NUM9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RETSATQ6NUM9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RETSATQ6NUM9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RETSATQ6NUM9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RETSATQ6NUM9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RETSATQ6NUM9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RETSATQ6NUM9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RETSATQ6NUM9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RETSATQ6NUM9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RETSATQ6NUM9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RETSATQ6NUM9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms