Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT80Q6KB66 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT80Q6KB66 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT80Q6KB66 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT80Q6KB66 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT80Q6KB66 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT80Q6KB66 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT80Q6KB66 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT80Q6KB66 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT80Q6KB66 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT80Q6KB66 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT80Q6KB66 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT80Q6KB66 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT80Q6KB66 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT80Q6KB66 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT80Q6KB66 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT80Q6KB66 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT80Q6KB66 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT80Q6KB66 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT80Q6KB66 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT80Q6KB66 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT80Q6KB66 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT80Q6KB66 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT80Q6KB66 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KRT80Q6KB66 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KRT80Q6KB66 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT80Q6KB66 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT80Q6KB66 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms