Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ22

RAB12, Ras-related protein Rab-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12Q6IQ22 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB12Q6IQ22 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB12Q6IQ22 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB12Q6IQ22 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB12Q6IQ22 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB12Q6IQ22 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB12Q6IQ22 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB12Q6IQ22 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms