Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CARMIL2Q6F5E8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CARMIL2Q6F5E8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CARMIL2Q6F5E8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CARMIL2Q6F5E8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CARMIL2Q6F5E8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CARMIL2Q6F5E8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CARMIL2Q6F5E8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CARMIL2Q6F5E8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CARMIL2Q6F5E8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CARMIL2Q6F5E8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
CARMIL2Q6F5E8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
CARMIL2Q6F5E8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CARMIL2Q6F5E8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CARMIL2Q6F5E8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
CARMIL2Q6F5E8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CARMIL2Q6F5E8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CARMIL2Q6F5E8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CARMIL2Q6F5E8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CARMIL2Q6F5E8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CARMIL2Q6F5E8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CARMIL2Q6F5E8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CARMIL2Q6F5E8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
CARMIL2Q6F5E8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CARMIL2Q6F5E8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CARMIL2Q6F5E8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CARMIL2Q6F5E8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CARMIL2Q6F5E8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CARMIL2Q6F5E8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CARMIL2Q6F5E8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CARMIL2Q6F5E8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.58
CARMIL2Q6F5E8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CARMIL2Q6F5E8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CARMIL2Q6F5E8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CARMIL2Q6F5E8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms