Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATL3Q6DD88 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATL3Q6DD88 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ATL3Q6DD88 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms