Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCTD16Q68DU8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms