Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LGSNQ5TDP6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGSNQ5TDP6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LGSNQ5TDP6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms