Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms