Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HP1BP3Q5SSJ5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HP1BP3Q5SSJ5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms