Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC39AQ5SRH9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC39AQ5SRH9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC39AQ5SRH9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC39AQ5SRH9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC39AQ5SRH9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TTC39AQ5SRH9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TTC39AQ5SRH9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TTC39AQ5SRH9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTC39AQ5SRH9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TTC39AQ5SRH9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TTC39AQ5SRH9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TTC39AQ5SRH9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms