Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO47Q5MNV8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO47Q5MNV8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms