Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPANXN4Q5MJ08 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPANXN4Q5MJ08 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPANXN4Q5MJ08 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms