Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms