Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGAP29Q52LW3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGAP29Q52LW3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGAP29Q52LW3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms