Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LSM12Q3MHD2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM12Q3MHD2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM12Q3MHD2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms