Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL38Q2WGJ6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms