Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL98

VMAC, Vimentin-type intermediate filament-associated coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMACQ2NL98 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VMACQ2NL98 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VMACQ2NL98 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms