Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSPP1Q1MSJ5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSPP1Q1MSJ5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms