Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GEN1Q17RS7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GEN1Q17RS7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GEN1Q17RS7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24■■□□□ 1.43
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