Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIK5Q16478 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GRIK5Q16478 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIK5Q16478 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIK5Q16478 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
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