Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFRLQ15198 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFRLQ15198 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
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