Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX17Q15036 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX17Q15036 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
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