Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC39.02■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC38.97■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
GAPVD1Q14C86 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC38.94■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
GAPVD1Q14C86 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
GAPVD1Q14C86 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
GAPVD1Q14C86 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
GAPVD1Q14C86 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
GAPVD1Q14C86 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
GAPVD1Q14C86 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
GAPVD1Q14C86 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
GAPVD1Q14C86 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
GAPVD1Q14C86 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
GAPVD1Q14C86 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
GAPVD1Q14C86 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
GAPVD1Q14C86 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
GAPVD1Q14C86 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
GAPVD1Q14C86 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC38.84■■■■□ 3.81
GAPVD1Q14C86 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
GAPVD1Q14C86 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
GAPVD1Q14C86 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
GAPVD1Q14C86 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
GAPVD1Q14C86 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
GAPVD1Q14C86 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
GAPVD1Q14C86 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
GAPVD1Q14C86 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
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