Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMCO1Q147U7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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