Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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IRF3Q14653 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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