Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
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IRF3Q14653 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF3Q14653 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF3Q14653 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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