Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOFQ13790 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOFQ13790 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOFQ13790 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOFQ13790 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOFQ13790 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOFQ13790 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOFQ13790 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOFQ13790 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOFQ13790 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOFQ13790 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOFQ13790 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOFQ13790 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOFQ13790 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOFQ13790 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOFQ13790 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOFQ13790 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOFQ13790 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOFQ13790 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOFQ13790 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOFQ13790 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOFQ13790 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOFQ13790 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOFQ13790 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOFQ13790 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOFQ13790 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOFQ13790 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOFQ13790 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOFQ13790 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOFQ13790 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOFQ13790 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOFQ13790 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOFQ13790 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOFQ13790 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOFQ13790 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOFQ13790 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOFQ13790 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOFQ13790 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOFQ13790 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOFQ13790 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
APOFQ13790 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOFQ13790 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOFQ13790 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOFQ13790 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
APOFQ13790 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOFQ13790 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOFQ13790 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOFQ13790 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOFQ13790 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOFQ13790 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOFQ13790 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOFQ13790 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOFQ13790 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOFQ13790 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOFQ13790 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APOFQ13790 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOFQ13790 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOFQ13790 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOFQ13790 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOFQ13790 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
APOFQ13790 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOFQ13790 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOFQ13790 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOFQ13790 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
APOFQ13790 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOFQ13790 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOFQ13790 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOFQ13790 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOFQ13790 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOFQ13790 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOFQ13790 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
APOFQ13790 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOFQ13790 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOFQ13790 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOFQ13790 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOFQ13790 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOFQ13790 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOFQ13790 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOFQ13790 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOFQ13790 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOFQ13790 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOFQ13790 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APOFQ13790 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APOFQ13790 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOFQ13790 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APOFQ13790 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOFQ13790 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOFQ13790 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APOFQ13790 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOFQ13790 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOFQ13790 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOFQ13790 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOFQ13790 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOFQ13790 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOFQ13790 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOFQ13790 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOFQ13790 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOFQ13790 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOFQ13790 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOFQ13790 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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