Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX6Q13608 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PEX6Q13608 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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