Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf61Q13536 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf61Q13536 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf61Q13536 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf61Q13536 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf61Q13536 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf61Q13536 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf61Q13536 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf61Q13536 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf61Q13536 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf61Q13536 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf61Q13536 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf61Q13536 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf61Q13536 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf61Q13536 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf61Q13536 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf61Q13536 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf61Q13536 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf61Q13536 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf61Q13536 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf61Q13536 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf61Q13536 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf61Q13536 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf61Q13536 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf61Q13536 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf61Q13536 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf61Q13536 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf61Q13536 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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