Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PICALMQ13492 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PICALMQ13492 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PICALMQ13492 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
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