Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2V1Q13404 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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UBE2V1Q13404 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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UBE2V1Q13404 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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UBE2V1Q13404 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBE2V1Q13404 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2V1Q13404 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2V1Q13404 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2V1Q13404 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2V1Q13404 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2V1Q13404 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2V1Q13404 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2V1Q13404 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2V1Q13404 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2V1Q13404 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2V1Q13404 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBE2V1Q13404 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2V1Q13404 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2V1Q13404 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2V1Q13404 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2V1Q13404 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2V1Q13404 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2V1Q13404 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2V1Q13404 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBE2V1Q13404 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2V1Q13404 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2V1Q13404 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBE2V1Q13404 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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