Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLF1Q13351 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLF1Q13351 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms