Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFX1Q12986 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFX1Q12986 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFX1Q12986 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
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