Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXC1Q12948 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXC1Q12948 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms