Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPTFQ12830 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BPTFQ12830 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPTFQ12830 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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