Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFEMP1Q12805 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
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