Protein–RNA interactions for Protein: Q12009

TRM8, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM8Q12009 YBR144CYBR144C 315 nt5.71□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 CLP1YOR250C 1338 nt5.71□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 PTK2YJR059W 2457 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 HER2YMR293C 1395 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 CDC19YAL038W 1503 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 CNE1YAL058W 1509 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 EIS1YMR031C 2532 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 YDL119CYDL119C 924 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 YDL121CYDL121C 450 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 GTR1YML121W 933 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 TAF4YMR005W 1167 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 YNR068CYNR068C 819 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 AIM41YOR215C 558 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 YOR292CYOR292C 930 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 AMA1YGR225W 1782 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 MCM3YEL032W 2916 nt5.69□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 RAI1YGL246C 1164 nt5.69□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 CBP4YGR174C 513 nt5.69□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 YGR176WYGR176W 348 nt5.69□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.69□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 RPS9AYPL081W 594 nt5.69□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 UBA3YPR066W 900 nt5.69□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 TAX4YJL083W 1815 nt5.69□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 APE1YKL103C 1545 nt5.69□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 ALD6YPL061W 1503 nt5.69□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 VHS1YDR247W 1386 nt5.68□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 PMA1YGL008C 2757 nt5.68□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 CCZ1YBR131W 2115 nt5.68□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 ORC5YNL261W 1440 nt5.68□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 MPM1YJL066C 759 nt5.68□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 VPS4YPR173C 1314 nt5.68□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 MPP10YJR002W 1782 nt5.67□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 CLB2YPR119W 1476 nt5.67□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 MDH3YDL078C 1032 nt5.67□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 RTN1YDR233C 888 nt5.67□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 RHO3YIL118W 696 nt5.67□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 MID2YLR332W 1131 nt5.67□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 YET2YMR040W 483 nt5.67□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 PCL10YGL134W 1302 nt5.67□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 STB5YHR178W 2232 nt5.67□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 MST1YKL194C 1389 nt5.67□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 YDR109CYDR109C 2148 nt5.66□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 ERC1YHR032W 1746 nt5.66□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 MAD3YJL013C 1548 nt5.66□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.66□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.66□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.66□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.66□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.66□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.66□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.66□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.66□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 MRPL22YNL177C 930 nt5.66□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 YNR040WYNR040W 771 nt5.66□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 snR32snR32 188 nt5.66□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 MAL11YGR289C 1851 nt5.66□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 APE3YBR286W 1614 nt5.66□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 CLA4YNL298W 2529 nt5.66□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 SDA1YGR245C 2304 nt5.65□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 SNM1YDR478W 597 nt5.65□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 UBC6YER100W 753 nt5.65□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 VMA4YOR332W 702 nt5.65□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 RPN7YPR108W 1290 nt5.65□□□□□ -1.5
TRM8Q12009 HOF1YMR032W 2010 nt5.64□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 VAM7YGL212W 951 nt5.64□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 FMP48YGR052W 1110 nt5.64□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 YJU3YKL094W 942 nt5.64□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 YPR109WYPR109W 885 nt5.64□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 PKC1YBL105C 3456 nt5.64□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 UTP6YDR449C 1323 nt5.64□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 VPS70YJR126C 2436 nt5.63□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.63□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 RRP4YHR069C 1080 nt5.63□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 YGP1YNL160W 1065 nt5.63□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 YPL113CYPL113C 1191 nt5.63□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 PPR1YLR014C 2715 nt5.63□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 PRP46YPL151C 1356 nt5.63□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 BUD14YAR014C 2130 nt5.63□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 BRL1YHR036W 1416 nt5.63□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 NFI1YOR156C 2181 nt5.62□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 PYC1YGL062W 3537 nt5.62□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 YCL065WYCL065W 369 nt5.62□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 RHB1YCR027C 630 nt5.62□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 CWC21YDR482C 408 nt5.62□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 RPL12AYEL054C 498 nt5.62□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 YGR022CYGR022C 330 nt5.62□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 IPI1YHR085W 1005 nt5.62□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 PAN6YIL145C 930 nt5.62□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 DJP1YIR004W 1299 nt5.62□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 PHO86YJL117W 936 nt5.62□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 MRP17YKL003C 396 nt5.62□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 RPL10YLR075W 666 nt5.62□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 NRM1YNR009W 750 nt5.62□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 GSH2YOL049W 1476 nt5.62□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 YPK2YMR104C 2034 nt5.62□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 SKI6YGR195W 741 nt5.61□□□□□ -1.51
TRM8Q12009 RSC30YHR056C 2652 nt5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.6 ms