Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC173Q0VFZ6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC173Q0VFZ6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC173Q0VFZ6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms