Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C2orf54Q08AI8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C2orf54Q08AI8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms