Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSRP1Q08945 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSRP1Q08945 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms