Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD300CQ08708 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD300CQ08708 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms