Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDR1Q08345 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDR1Q08345 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms