Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CXCL9Q07325 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CXCL9Q07325 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CXCL9Q07325 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CXCL9Q07325 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms