Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GABPAQ06546 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GABPAQ06546 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GABPAQ06546 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GABPAQ06546 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GABPAQ06546 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GABPAQ06546 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GABPAQ06546 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GABPAQ06546 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GABPAQ06546 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GABPAQ06546 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GABPAQ06546 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GABPAQ06546 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GABPAQ06546 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GABPAQ06546 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
GABPAQ06546 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GABPAQ06546 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GABPAQ06546 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GABPAQ06546 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GABPAQ06546 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GABPAQ06546 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GABPAQ06546 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GABPAQ06546 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GABPAQ06546 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GABPAQ06546 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GABPAQ06546 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GABPAQ06546 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GABPAQ06546 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GABPAQ06546 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GABPAQ06546 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GABPAQ06546 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GABPAQ06546 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GABPAQ06546 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GABPAQ06546 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GABPAQ06546 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GABPAQ06546 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GABPAQ06546 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
GABPAQ06546 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms