Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeastyeast

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE3Q05541 PGU1YJR153W 1086 nt6.99□□□□□ -1.29
NSE3Q05541 YLR402WYLR402W 192 nt6.99□□□□□ -1.29
NSE3Q05541 CAR1YPL111W 1002 nt6.99□□□□□ -1.29
NSE3Q05541 POS5YPL188W 1245 nt6.99□□□□□ -1.29
NSE3Q05541 DXO1YDR370C 1329 nt6.99□□□□□ -1.29
NSE3Q05541 FRE7YOL152W 1863 nt6.98□□□□□ -1.29
NSE3Q05541 FPR2YDR519W 408 nt6.98□□□□□ -1.29
NSE3Q05541 MLC1YGL106W 450 nt6.98□□□□□ -1.29
NSE3Q05541 LSM12YHR121W 564 nt6.98□□□□□ -1.29
NSE3Q05541 MRPL13YKR006C 795 nt6.98□□□□□ -1.29
NSE3Q05541 PIN2YOR104W 849 nt6.98□□□□□ -1.29
NSE3Q05541 SLX5YDL013W 1860 nt6.97□□□□□ -1.29
NSE3Q05541 YHR095WYHR095W 495 nt6.97□□□□□ -1.29
NSE3Q05541 ERP2YAL007C 648 nt6.97□□□□□ -1.29
NSE3Q05541 YLR194CYLR194C 765 nt6.97□□□□□ -1.29
NSE3Q05541 TAL1YLR354C 1008 nt6.97□□□□□ -1.29
NSE3Q05541 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt6.97□□□□□ -1.29
NSE3Q05541 MLC2YPR188C 492 nt6.97□□□□□ -1.29
NSE3Q05541 YAP1801YHR161C 1914 nt6.97□□□□□ -1.29
NSE3Q05541 YGL036WYGL036W 2730 nt6.97□□□□□ -1.29
NSE3Q05541 MIF2YKL089W 1650 nt6.96□□□□□ -1.29
NSE3Q05541 UGO1YDR470C 1509 nt6.96□□□□□ -1.29
NSE3Q05541 COX26YDR119W-A 201 nt6.96□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 YFL064CYFL064C 525 nt6.96□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 VMA4YOR332W 702 nt6.96□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 OAZ1YPL052W 879 nt6.96□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 YPR109WYPR109W 885 nt6.96□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 YPR202WYPR202W 717 nt6.96□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 YDR514CYDR514C 1452 nt6.96□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 ICL2YPR006C 1728 nt6.96□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 TEA1YOR337W 2280 nt6.96□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 TRP5YGL026C 2124 nt6.95□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 GLN3YER040W 2193 nt6.95□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 GIP2YER054C 1647 nt6.95□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 KNH1YDL049C 807 nt6.95□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 RAD17YOR368W 1206 nt6.95□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 CLN1YMR199W 1641 nt6.94□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 RTT106YNL206C 1368 nt6.94□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 MCM21YDR318W 1107 nt6.93□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 YLR118CYLR118C 684 nt6.93□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 TFS1YLR178C 660 nt6.93□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 YOL050CYOL050C 321 nt6.93□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 VPS4YPR173C 1314 nt6.93□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 ACO1YLR304C 2337 nt6.92□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 CAD1YDR423C 1230 nt6.92□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 SNZ3YFL059W 897 nt6.92□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 ERV14YGL054C 417 nt6.92□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 VMA16YHR026W 642 nt6.92□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 YBL029WYBL029W 1131 nt6.92□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 SNZ2YNL333W 897 nt6.92□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 UTP9YHR196W 1728 nt6.92□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 ISC1YER019W 1434 nt6.92□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 TIM54YJL054W 1437 nt6.92□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 IMA5YJL216C 1746 nt6.91□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 NUP1YOR098C 3231 nt6.91□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 YDL034WYDL034W 345 nt6.91□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 YDL057WYDL057W 987 nt6.91□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 COX9YDL067C 180 nt6.91□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 YGR011WYGR011W 327 nt6.91□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 YIL086CYIL086C 309 nt6.91□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 YKL151CYKL151C 1014 nt6.91□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 YKL169CYKL169C 384 nt6.91□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 SPC34YKR037C 888 nt6.91□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 YLL059CYLL059C 507 nt6.91□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 PEX32YBR168W 1242 nt6.91□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 SMF2YHR050W 1650 nt6.9□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt6.9□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt6.9□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt6.9□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt6.9□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt6.9□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt6.9□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt6.9□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt6.9□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt6.9□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt6.9□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 CIS3YJL158C 684 nt6.9□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt6.9□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 PGA3YML125C 939 nt6.9□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 TIF34YMR146C 1044 nt6.9□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 NPT1YOR209C 1290 nt6.9□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 PAF1YBR279W 1338 nt6.9□□□□□ -1.3
NSE3Q05541 XPT1YJR133W 630 nt6.89□□□□□ -1.31
NSE3Q05541 COS9YKL219W 1224 nt6.89□□□□□ -1.31
NSE3Q05541 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt6.89□□□□□ -1.31
NSE3Q05541 QRI1YDL103C 1434 nt6.89□□□□□ -1.31
NSE3Q05541 BUL1YMR275C 2931 nt6.88□□□□□ -1.31
NSE3Q05541 SOG2YOR353C 2376 nt6.88□□□□□ -1.31
NSE3Q05541 SKY1YMR216C 2229 nt6.88□□□□□ -1.31
NSE3Q05541 HXT3YDR345C 1704 nt6.88□□□□□ -1.31
NSE3Q05541 ATR1YML116W 1629 nt6.88□□□□□ -1.31
NSE3Q05541 ADE13YLR359W 1449 nt6.88□□□□□ -1.31
NSE3Q05541 SNM1YDR478W 597 nt6.88□□□□□ -1.31
NSE3Q05541 SPO74YGL170C 1242 nt6.88□□□□□ -1.31
NSE3Q05541 GAT4YIR013C 366 nt6.88□□□□□ -1.31
NSE3Q05541 APN1YKL114C 1104 nt6.88□□□□□ -1.31
NSE3Q05541 OAC1YKL120W 975 nt6.88□□□□□ -1.31
NSE3Q05541 OMA1YKR087C 1038 nt6.88□□□□□ -1.31
NSE3Q05541 LDB18YLL049W 540 nt6.88□□□□□ -1.31
NSE3Q05541 TOM40YMR203W 1164 nt6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 115.8 ms