Protein–RNA interactions for Protein: Q04062

RPN9, 26S proteasome regulatory subunit RPN9, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN9Q04062 SUE1YPR151C 621 nt5.5□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 HSF1YGL073W 2502 nt5.5□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 TAX4YJL083W 1815 nt5.5□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 ENT2YLR206W 1842 nt5.5□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 SNT2YGL131C 4212 nt5.49□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 NSI1YDR026C 1713 nt5.49□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 YFL034WYFL034W 3222 nt5.49□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.49□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 DON1YDR273W 1098 nt5.49□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 KRE9YJL174W 831 nt5.49□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 YJL193WYJL193W 1209 nt5.49□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 YKL223WYKL223W 333 nt5.49□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 FOB1YDR110W 1701 nt5.48□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 RRN3YKL125W 1884 nt5.48□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 TAH18YPR048W 1872 nt5.48□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 TEF1YPR080W 1377 nt5.48□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 TEF2YBR118W 1377 nt5.48□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.48□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 YGR176WYGR176W 348 nt5.48□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.48□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 DAL82YNL314W 768 nt5.48□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 MET7YOR241W 1647 nt5.48□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 BRL1YHR036W 1416 nt5.48□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 SIP2YGL208W 1248 nt5.47□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 EFM4YIL064W 774 nt5.47□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 YNR048WYNR048W 1182 nt5.47□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 URA7YBL039C 1740 nt5.47□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 SEC12YNR026C 1416 nt5.47□□□□□ -1.53
RPN9Q04062 RTT106YNL206C 1368 nt5.46□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 YIL060WYIL060W 435 nt5.46□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 UBC4YBR082C 447 nt5.46□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 PRP40YKL012W 1752 nt5.46□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 RPT1YKL145W 1404 nt5.46□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 GEP3YOR205C 1671 nt5.46□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 YNL095CYNL095C 1929 nt5.46□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 CCZ1YBR131W 2115 nt5.45□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 RAD53YPL153C 2466 nt5.45□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 GIR2YDR152W 798 nt5.45□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 CAD1YDR423C 1230 nt5.45□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 PGU1YJR153W 1086 nt5.45□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 PTR2YKR093W 1806 nt5.45□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 NOP2YNL061W 1857 nt5.45□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 UTP18YJL069C 1785 nt5.44□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 GDB1YPR184W 4611 nt5.44□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 YLH47YPR125W 1365 nt5.44□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 RHB1YCR027C 630 nt5.44□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 YDL034WYDL034W 345 nt5.44□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 YDR541CYDR541C 1035 nt5.44□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 COS6YGR295C 1146 nt5.44□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 MTQ1YNL063W 945 nt5.44□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 RHO2YNL090W 579 nt5.44□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 YNL228WYNL228W 777 nt5.44□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 ARO7YPR060C 771 nt5.44□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 snR32snR32 188 nt5.44□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 DBF4YDR052C 2115 nt5.43□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 SFC1YJR095W 969 nt5.43□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 COS9YKL219W 1224 nt5.43□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 YLL059CYLL059C 507 nt5.43□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 PSH1YOL054W 1221 nt5.43□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.43□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 YPR195CYPR195C 330 nt5.43□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.43□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 RRT2YBR246W 1164 nt5.43□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 NUP1YOR098C 3231 nt5.43□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 CLP1YOR250C 1338 nt5.43□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 ADY2YCR010C 852 nt5.42□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 YJR115WYJR115W 510 nt5.42□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 YNL194CYNL194C 906 nt5.42□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 TBF1YPL128C 1689 nt5.42□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 RIM101YHL027W 1878 nt5.42□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 ACS2YLR153C 2052 nt5.42□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 VTC2YFL004W 2487 nt5.42□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 RET1YOR207C 3450 nt5.42□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 SPC97YHR172W 2472 nt5.41□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 PPR1YLR014C 2715 nt5.41□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 DED81YHR019C 1665 nt5.41□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 PWP1YLR196W 1731 nt5.41□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 MTQ2YDR140W 666 nt5.41□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 IPK1YDR315C 846 nt5.41□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 ELC1YPL046C 300 nt5.41□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 YPR098CYPR098C 486 nt5.41□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 ELP2YGR200C 2367 nt5.41□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 MNN2YBR015C 1794 nt5.4□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 EAF5YEL018W 840 nt5.4□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 RHO3YIL118W 696 nt5.4□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 SYN8YAL014C 768 nt5.4□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 BUD14YAR014C 2130 nt5.4□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 SCP1YOR367W 603 nt5.4□□□□□ -1.54
RPN9Q04062 ASH1YKL185W 1767 nt5.39□□□□□ -1.55
RPN9Q04062 UBX2YML013W 1755 nt5.39□□□□□ -1.55
RPN9Q04062 TOS4YLR183C 1470 nt5.39□□□□□ -1.55
RPN9Q04062 RSC30YHR056C 2652 nt5.39□□□□□ -1.55
RPN9Q04062 YHR095WYHR095W 495 nt5.39□□□□□ -1.55
RPN9Q04062 POR1YNL055C 852 nt5.39□□□□□ -1.55
RPN9Q04062 CBC2YPL178W 627 nt5.39□□□□□ -1.55
RPN9Q04062 EXO1YOR033C 2109 nt5.39□□□□□ -1.55
RPN9Q04062 CDS1YBR029C 1374 nt5.39□□□□□ -1.55
RPN9Q04062 CYK3YDL117W 2658 nt5.38□□□□□ -1.55
RPN9Q04062 VAM7YGL212W 951 nt5.38□□□□□ -1.55
RPN9Q04062 YLR194CYLR194C 765 nt5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.3 ms