Protein–RNA interactions for Protein: Q03619

TY1B-ER2, Transposon Ty1-ER2 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-ER2Q03619 YPR098CYPR098C 486 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1B-ER2Q03619 YNL040WYNL040W 1371 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1B-ER2Q03619 ECM3YOR092W 1842 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1B-ER2Q03619 NDE1YMR145C 1683 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1B-ER2Q03619 ERD1YDR414C 1089 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1B-ER2Q03619 SPN1YPR133C 1233 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1B-ER2Q03619 SIF2YBR103W 1608 nt7.52□□□□□ -1.2
TY1B-ER2Q03619 SKI2YLR398C 3864 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 MKS1YNL076W 1755 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 PPM1YDR435C 987 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 NAG1YGR031C-A 492 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 NIT2YJL126W 924 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 APS1YLR170C 471 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 YNL217WYNL217W 981 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 CIN5YOR028C 888 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 RAD57YDR004W 1383 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt7.51□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 MAP2YBL091C 1266 nt7.51□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 RRT2YBR246W 1164 nt7.51□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 YML057C-AYML057C-A 390 nt7.51□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 PGA2YNL149C 390 nt7.51□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 GLN3YER040W 2193 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 KTI12YKL110C 942 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 YAR023CYAR023C 540 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 NMA1YLR328W 1206 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 KNS1YLL019C 2214 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 CLB1YGR108W 1416 nt7.49□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 ECM10YEL030W 1935 nt7.49□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 BSP1YPR171W 1731 nt7.49□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 SWI1YPL016W 3945 nt7.49□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 HRR25YPL204W 1485 nt7.49□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 HXT3YDR345C 1704 nt7.49□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 YIF1YNL263C 945 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 HIR1YBL008W 2523 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 FRE6YLL051C 2139 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 VPS5YOR069W 2028 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 YKE4YIL023C 1041 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 RPL15BYMR121C 615 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 YBL044WYBL044W 369 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 SCW10YMR305C 1170 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 PFA3YNL326C 1011 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 HXT5YHR096C 1779 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 NGR1YBR212W 2019 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 MMT2YPL224C 1455 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 FUI1YBL042C 1920 nt7.47□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 AZR1YGR224W 1842 nt7.47□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 SIP2YGL208W 1248 nt7.46□□□□□ -1.21
TY1B-ER2Q03619 SNU71YGR013W 1863 nt7.46□□□□□ -1.22
TY1B-ER2Q03619 YDR133CYDR133C 336 nt7.46□□□□□ -1.22
TY1B-ER2Q03619 YML101C-AYML101C-A 318 nt7.46□□□□□ -1.22
TY1B-ER2Q03619 PCL1YNL289W 840 nt7.46□□□□□ -1.22
TY1B-ER2Q03619 HFI1YPL254W 1467 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1B-ER2Q03619 RHO4YKR055W 876 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1B-ER2Q03619 YOR024WYOR024W 324 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1B-ER2Q03619 STB3YDR169C 1542 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1B-ER2Q03619 NOP16YER002W 696 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1B-ER2Q03619 KEX2YNL238W 2445 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1B-ER2Q03619 CDC43YGL155W 1131 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1B-ER2Q03619 YHR140WYHR140W 720 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1B-ER2Q03619 THP1YOL072W 1368 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1B-ER2Q03619 PDI1YCL043C 1569 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1B-ER2Q03619 SKY1YMR216C 2229 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1B-ER2Q03619 RHO2YNL090W 579 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1B-ER2Q03619 TRM10YOL093W 882 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1B-ER2Q03619 snR19snR19 568 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1B-ER2Q03619 EXO70YJL085W 1872 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1B-ER2Q03619 FOL1YNL256W 2475 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1B-ER2Q03619 UGA2YBR006W 1494 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1B-ER2Q03619 MRM2YGL136C 963 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1B-ER2Q03619 YNL174WYNL174W 573 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1B-ER2Q03619 ICL2YPR006C 1728 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1B-ER2Q03619 YPL191CYPL191C 1083 nt7.4□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 HAS1YMR290C 1518 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 HXT15YDL245C 1704 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 HXT16YJR158W 1704 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 GLO2YDR272W 825 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 YKR041WYKR041W 753 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 SWI3YJL176C 2478 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 SAC6YDR129C 1929 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 FOX2YKR009C 2703 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 LEM3YNL323W 1245 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 ECM23YPL021W 564 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 FAP1YNL023C 2898 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 SPL2YHR136C 447 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 FUN19YAL034C 1242 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 POP3YNL282W 588 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 REI1YBR267W 1182 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 YOL075CYOL075C 3885 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 SUP56tL(CAA)A 82 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 SUP53tL(CAA)C 82 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 SUP54tL(CAA)G2 82 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 ATR1YML116W 1629 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1B-ER2Q03619 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.2 ms