Protein–RNA interactions for Protein: Q01813

PFKP, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKPQ01813 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PFKPQ01813 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PFKPQ01813 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PFKPQ01813 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PFKPQ01813 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PFKPQ01813 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PFKPQ01813 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PFKPQ01813 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PFKPQ01813 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PFKPQ01813 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PFKPQ01813 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PFKPQ01813 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PFKPQ01813 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PFKPQ01813 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PFKPQ01813 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PFKPQ01813 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFKPQ01813 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKPQ01813 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFKPQ01813 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PFKPQ01813 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFKPQ01813 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKPQ01813 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKPQ01813 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKPQ01813 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms