Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IFITM3Q01628 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFITM3Q01628 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFITM3Q01628 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms